Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TMED1Q13445 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TMED1Q13445 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TMED1Q13445 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TMED1Q13445 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TMED1Q13445 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TMED1Q13445 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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