Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SF3B2Q13435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SF3B2Q13435 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SF3B2Q13435 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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