Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MRPL49Q13405 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRPL49Q13405 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL49Q13405 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms