Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2V1Q13404 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2V1Q13404 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2V1Q13404 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2V1Q13404 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2V1Q13404 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2V1Q13404 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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