Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMS2P3Q13401 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PMS2P3Q13401 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P3Q13401 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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