Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PDE3BQ13370 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
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