Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2BQ13224 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2BQ13224 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
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