Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIA1Q13136 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA1Q13136 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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