Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H3Q13133 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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