Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAA1Q13131 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAA1Q13131 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms