Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP4Q13115 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP4Q13115 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP4Q13115 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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