Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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