Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT88Q13099 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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IFT88Q13099 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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IFT88Q13099 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT88Q13099 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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