Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRDNQ13061 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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