Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRN3Q13033 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRN3Q13033 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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