Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCB1Q12824 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCB1Q12824 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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