Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN3Q08043 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms