Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CXCL9Q07325 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms