Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP4Q07065 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms