Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDSPL2Q05D32 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms