Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTK2Q05397 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms