Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBE1Q04446 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms