Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 UBP7YIL156W 3216 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YDL071CYDL071C 375 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RAM1YDL090C 1296 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 THI13YDL244W 1023 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 THI11YJR156C 1023 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 OSW5YMR148W 447 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RPG1YBR079C 2895 nt4.63□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 MMR1YLR190W 1476 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RCM1YNL022C 1473 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 GSM1YJL103C 1857 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 CBP1YJL209W 1965 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 IZH3YLR023C 1632 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RPL18BYNL301C 561 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 SSH1YBR283C 1473 nt4.62□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YPK9YOR291W 4419 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 SIR2YDL042C 1689 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 MCM4YPR019W 2802 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 AAD3YCR107W 1092 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RPS11AYDR025W 471 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 UBC6YER100W 753 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YGR122WYGR122W 1209 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 AIM26YKL037W 357 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 SEC72YLR292C 582 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YPL025CYPL025C 558 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 SMA1YPL027W 738 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 VHS3YOR054C 2025 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 ARG4YHR018C 1392 nt4.61□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 SAP155YFR040W 3009 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RPB7YDR404C 516 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 PAU17YLL025W 375 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 FAR8YMR029C 1572 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 VID28YIL017C 2766 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RPO21YDL140C 5202 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 GCV1YDR019C 1203 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 RSA3YLR221C 663 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YMR130WYMR130W 909 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 GPI18YBR004C 1302 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 CHL1YPL008W 2586 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 PBN1YCL052C 1251 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX2Q04228 YCF1YDR135C 4548 nt4.59□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 AVT1YJR001W 1809 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YDL124WYDL124W 939 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YIL028WYIL028W 399 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 ERG20YJL167W 1059 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YML119WYML119W 1074 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 LAP2YNL045W 2016 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 ARP10YDR106W 855 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 GLE2YER107C 1098 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 BIO2YGR286C 1128 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YHR112CYHR112C 1137 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 KTR2YKR061W 1278 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YKR104WYKR104W 921 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YOL035CYOL035C 303 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SUM1YDR310C 3189 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 HFA1YMR207C 6372 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 RAD4YER162C 2265 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YDL032WYDL032W 312 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 IMP1YMR150C 573 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YNR061CYNR061C 660 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 EFM2YBR271W 1260 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 FPK1YNR047W 2682 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 FAR10YLR238W 1437 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 PPQ1YPL179W 1650 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 GAL11YOL051W 3246 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 snR7-LsnR7-L 214 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YDR090CYDR090C 933 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YGR139WYGR139W 339 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SHE1YBL031W 1017 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YMR084WYMR084W 789 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 PHA2YNL316C 1005 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 NUG1YER006W 1563 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SVF1YDR346C 1446 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 MRH4YGL064C 1686 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SMP1YBR182C 1359 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SRO7YPR032W 3102 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 RPS19AYOL121C 435 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 snR3snR3 194 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YCL022CYCL022C 516 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 TGL4YKR089C 2733 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SMF1YOL122C 1728 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 LEU1YGL009C 2340 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 ALG2YGL065C 1512 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 HIS5YIL116W 1158 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YIR043CYIR043C 693 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YLR049CYLR049C 1287 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 SIW14YNL032W 846 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 YSH1YLR277C 2340 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX2Q04228 NOC2YOR206W 2133 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX2Q04228 GPI13YLL031C 3054 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX2Q04228 YLR152CYLR152C 1731 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX2Q04228 ECM22YLR228C 2445 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX2Q04228 ALG9YNL219C 1668 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX2Q04228 SNM1YDR478W 597 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms