Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP27A1Q02318 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP27A1Q02318 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP27A1Q02318 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms