Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHDQ02161 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHDQ02161 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHDQ02161 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHDQ02161 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHDQ02161 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHDQ02161 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHDQ02161 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHDQ02161 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHDQ02161 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHDQ02161 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHDQ02161 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHDQ02161 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHDQ02161 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHDQ02161 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHDQ02161 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHDQ02161 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHDQ02161 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms