Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLCB3Q01970 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms