Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A3Q01959 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A3Q01959 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms