Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
XPCQ01831 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XPCQ01831 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
XPCQ01831 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
XPCQ01831 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
XPCQ01831 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
XPCQ01831 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
XPCQ01831 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
XPCQ01831 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
XPCQ01831 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XPCQ01831 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms