Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTUD4Q01804 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTUD4Q01804 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD4Q01804 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms