Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAP4Q01664 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP4Q01664 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP4Q01664 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms