Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFITM3Q01628 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms