Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB2Q00722 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLCB2Q00722 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.6 ms