Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC42EP1Q00587 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42EP1Q00587 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms