Protein–RNA interactions for Protein: P98169

ZXDB, Zinc finger X-linked protein ZXDB, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZXDBP98169 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZXDBP98169 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZXDBP98169 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms