Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms