Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMAD3P84022 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD3P84022 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms