Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRB1P82279 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRB1P82279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRB1P82279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRB1P82279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRB1P82279 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRB1P82279 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRB1P82279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRB1P82279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRB1P82279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRB1P82279 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRB1P82279 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRB1P82279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRB1P82279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRB1P82279 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms