Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIM1P81133 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIM1P81133 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIM1P81133 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIM1P81133 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIM1P81133 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIM1P81133 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIM1P81133 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms