Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC1P78348 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms