Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM193AP78312 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM193AP78312 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms