Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNRPNP63162 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms