Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBX1P62877 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBX1P62877 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms