Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP46P62068 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP46P62068 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP46P62068 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP46P62068 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP46P62068 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP46P62068 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP46P62068 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP46P62068 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP46P62068 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP46P62068 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP46P62068 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP46P62068 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP46P62068 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP46P62068 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms