Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms