Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2D3P61077 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBE2D3P61077 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms