Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFRD-1P60508 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms