Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms