Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms