Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB25P57735 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB25P57735 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB25P57735 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB25P57735 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB25P57735 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB25P57735 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB25P57735 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms