Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX3P56589 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX3P56589 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX3P56589 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX3P56589 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX3P56589 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX3P56589 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX3P56589 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX3P56589 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX3P56589 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX3P56589 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX3P56589 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms